MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Simkania negevensis Z plasmid pSn

Total Repeats: 362

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015710	ACA	2	6	680	685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_015710	ACT	2	6	725	730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_015710	GCAA	2	8	761	768	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_015710	ATCA	2	8	786	793	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_015710	TAA	2	6	832	837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015710	G	6	6	843	848	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015710	GTA	2	6	2143	2148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015710	T	7	7	2240	2246	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015710	GAA	2	6	2266	2271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015710	T	7	7	2272	2278	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015710	AGA	2	6	2331	2336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015710	TAA	2	6	2353	2358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015710	TA	3	6	2391	2396	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015710	GAAG	2	8	6820	6827	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015710	T	7	7	7395	7401	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015710	A	6	6	7469	7474	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015710	TAAA	2	8	7508	7515	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015710	TAT	2	6	7584	7589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015710	TAA	2	6	7957	7962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015710	GAAA	2	8	7968	7975	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015710	TCT	2	6	8624	8629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_015710	GGA	2	6	10309	10314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015710	A	7	7	10346	10352	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015710	CTCTT	2	10	10365	10374	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
25	NC_015710	AGA	2	6	10375	10380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015710	GAA	2	6	10384	10389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015710	GAT	2	6	12832	12837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015710	GA	4	8	12880	12887	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015710	CTTG	2	8	14031	14038	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_015710	CT	3	6	14057	14062	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_015710	GTC	2	6	14077	14082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_015710	TG	3	6	14087	14092	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015710	GAG	2	6	14133	14138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015710	T	6	6	14575	14580	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015710	AAC	2	6	14611	14616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_015710	GAA	2	6	16303	16308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015710	AAT	2	6	16313	16318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015710	T	7	7	16447	16453	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015710	T	6	6	16531	16536	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015710	TCAAA	2	10	16570	16579	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_015710	GAA	2	6	16691	16696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015710	A	6	6	16699	16704	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015710	AGG	2	6	16752	16757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015710	TGG	2	6	17458	17463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015710	CTT	2	6	17464	17469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_015710	CA	3	6	17540	17545	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_015710	A	6	6	17614	17619	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015710	T	6	6	18851	18856	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015710	AAT	2	6	19925	19930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015710	T	6	6	19940	19945	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015710	T	6	6	20395	20400	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015710	AAT	2	6	20407	20412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015710	AGG	2	6	20443	20448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015710	GAG	2	6	20503	20508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015710	TGA	2	6	20519	20524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015710	T	7	7	20545	20551	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015710	CTATT	2	10	20566	20575	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_015710	TGA	2	6	20580	20585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015710	CAA	2	6	20668	20673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_015710	GAT	3	9	20679	20687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015710	TAAT	2	8	20723	20730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015710	TATG	2	8	20788	20795	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015710	CGTT	2	8	22251	22258	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_015710	CT	3	6	22609	22614	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_015710	T	6	6	23553	23558	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015710	CTTCT	2	10	23577	23586	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
67	NC_015710	T	6	6	23589	23594	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015710	GTC	2	6	23602	23607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_015710	A	7	7	23647	23653	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015710	GA	3	6	23742	23747	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015710	CTC	2	6	23752	23757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_015710	CT	3	6	23840	23845	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_015710	TGA	2	6	23914	23919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015710	AAT	2	6	23939	23944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015710	GGAA	2	8	23945	23952	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015710	C	6	6	23992	23997	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
77	NC_015710	AGG	3	9	24003	24011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015710	GCAAT	2	10	24077	24086	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_015710	AGT	2	6	24177	24182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015710	ATG	2	6	24206	24211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015710	TTC	2	6	24316	24321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_015710	GTC	2	6	24380	24385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_015710	ATGGA	2	10	24420	24429	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015710	A	6	6	24462	24467	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015710	TTAA	2	8	24554	24561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015710	ATTA	2	8	24835	24842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015710	ATTAA	2	10	24863	24872	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015710	T	6	6	28235	28240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015710	TCAAA	2	10	28274	28283	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_015710	T	7	7	28388	28394	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015710	ATT	2	6	28430	28435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015710	ATTA	2	8	28446	28453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015710	TTATAT	2	12	29605	29616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015710	TAG	2	6	29746	29751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015710	TGA	2	6	30380	30385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015710	ATT	2	6	30398	30403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015710	T	6	6	30402	30407	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015710	AGTT	2	8	30409	30416	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015710	TCA	2	6	30441	30446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_015710	CTT	2	6	30466	30471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_015710	TAA	2	6	30494	30499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015710	A	7	7	30504	30510	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015710	ATT	2	6	30533	30538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015710	ATTT	2	8	30564	30571	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015710	AAT	2	6	30645	30650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015710	T	6	6	30650	30655	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015710	A	6	6	30667	30672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015710	AGG	2	6	32211	32216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015710	GGC	2	6	32306	32311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_015710	TAA	2	6	33872	33877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015710	TTC	2	6	33880	33885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_015710	TC	3	6	33890	33895	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_015710	AAG	2	6	33899	33904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015710	CT	3	6	34160	34165	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_015710	CA	3	6	35523	35528	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_015710	CT	3	6	35545	35550	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_015710	CTT	2	6	35590	35595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_015710	TTAG	2	8	35660	35667	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015710	TGT	2	6	35678	35683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015710	TTGC	2	8	35705	35712	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_015710	ATA	2	6	35719	35724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015710	ATA	2	6	40761	40766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015710	TCT	2	6	40792	40797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_015710	GAA	2	6	40815	40820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015710	A	6	6	40911	40916	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015710	ATC	2	6	40920	40925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_015710	GGA	2	6	41049	41054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015710	GAT	2	6	41064	41069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015710	CAT	2	6	41074	41079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_015710	TAA	2	6	41141	41146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015710	A	7	7	41157	41163	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015710	TAGA	2	8	41206	41213	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015710	A	6	6	41238	41243	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015710	CAA	2	6	41310	41315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_015710	ATC	2	6	41384	41389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_015710	AAT	2	6	41494	41499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015710	CTG	2	6	42063	42068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_015710	T	7	7	43016	43022	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015710	ACA	2	6	43177	43182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_015710	T	6	6	44864	44869	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015710	TTC	2	6	44880	44885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_015710	ATAA	2	8	44962	44969	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015710	ATA	2	6	47227	47232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015710	AGT	2	6	47242	47247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015710	ACA	2	6	47292	47297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_015710	GTT	2	6	47324	47329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015710	AC	3	6	47355	47360	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_015710	T	7	7	47374	47380	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015710	TCTT	2	8	47382	47389	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_015710	TTTA	2	8	47393	47400	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.